Havsmiljöinstitutet driver och medverkar i olika projekt och program till stöd för förvaltningen. Institutet utför uppdrag för myndigheter på nationell och regional nivå och bidrar med vetenskaplig rådgivning
Genom rådgivning och deltagande i projekt och referensgrupper får kommuner, vattenvårdsförbund, länsstyrelser och nationella myndigheter hjälp i sitt arbete. Här presenteras nationella, regionala och internationella projekt på årsbasis där Havsmiljöinstitutet bidragit med havsmiljörelaterad kompetens.