Förankringen vid fem universitet ger Havsmiljöinstitutet koppling till kommuner, länsstyrelser och vattenmyndigheter i de olika havsregionerna.
Havsmiljöinstitutets enhet vid Umeå universitet samverkar med Informationscentralen för Bottniska viken och bistår med vetenskaplig rådgivning.
Miljöanalytiker och forskare vid Havsmiljöinstitutets enhet vid Stockholms universitets Östersjöcentrum samverkar på olika sätt med det omgivande samhället, på kortare basis eller mer långvarigt som experter i specifika frågor.
Miljöanalytiker och kommunikatörer från Havsmiljöinstitutet sammankallande för Kontaktgrupp Västerhavet, med deltagare från Havs- och vattenmyndigheten, SMHI, SLU, länsstyrelserna i Västra Götaland, Halland och Skåne, Sjöfartsmuseet Akvariet, Västra Götalandsregionen samt Bohuskustens vattenvårdsförbund. Gruppen ger ut publikationen Västerhavet.
Inom projektet Baltspace samverkar Havsmiljöinstitutet med Länsstyrelsen i Skåne och har bidragit till att havsplaneringsnätverket utvecklats regionalt i Skåne och Öresund och även internationellt.
Havsmiljöinstitutets syntes om Hanöbukten har också lett till olika samarbeten i regionen.
Läs mer om universitetens deltagande i Havsmiljöinstitutets verksamhet och om regionala insatser: